SARS-CoV-2 - Données Omiques

Séquençage du SARS-CoV-2

Le séquencage complet du génome de cinq patients é un stade précoce de l'épidémie a été réalisé en Chine. Les résultats ont été publiées par Zhou et al. dans la revue Nature [1]. Les séquences obtenues sont presque identiques et partagent 79,6% de similarité de séquence avec le SRAS-CoV.

Les auteurs ont montré aussi que la séquence du nCoV 2019 est identique à 96% un coronavirus de chauve-souris.

La ressemblance avec du nouveaux virus aux SRAS-CoV ne se limite pas la séquence génomique, les auteurs ont également montré que le 2019-nCoV utilise le même récepteur d'entrée cellulaire - l'enzyme de conversion de l'angiotensine II (ACE2) - que les SRAS-CoV.

Sequence COVID-19
(Source : Zhou et al. 2020).

Le 31 janvier 2020, l'Institut Pasteur a annoncé avoir séquencé le génome complet du coronavirus de Wuhan.

Le séquençage s'est fait à la plateforme de microbiologie mutualisée (P2M).

Sequence COVID-19
(Source : Institut Pasteur).

Référence

  • [1] Zhou, P., Yang, X., Wang, X. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature 579, 270273 (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7